9. Muziejaus veiklos pagrindiniai tikslai:
9.1. kaupti, saugoti, tyrinėti ir populiarinti muziejines vertybes, parodančias Kauno tvirtovės, nacistinės ir sovietinės okupacijų, valstybingumo atkūrimo ir Kauno IX forto muziejaus istorijos etapus;
9.2. susieti kultūros paveldo apsaugą su visuomenės informavimo, kultūros bei edukacijos poreikių tenkinimu ir kultūros paslaugų teikimu;
9.3. saugoti ir puoselėti istorinę atmintį, skatinti pasididžiavimą savo valstybe.
10. Įgyvendindamas šiuos tikslus, Muziejus vykdo šias funkcijas:
10.1. įsigyja, tiria ir sistemina istorinę ir kultūrinę vertę turinčius eksponatus, formuoja Muziejaus rinkinius, parodančius Kauno tvirtovės, nacistinės ir sovietinės okupacijų, valstybingumo atkūrimo ir Kauno IX forto muziejaus istorijos etapus;
10.2. užtikrina sukauptų muziejinių vertybių apskaitą, tinkamas saugojimo sąlygas ir apsaugą, jų konservavimą ir restauravimą;
10.3. sudaro sąlygas Muziejuje saugomų muziejinių vertybių viešinimui: rengia nuolatines ir laikinas ekspozicijas, parodas bei kitus renginius Lietuvoje ir užsienyje, publikuoja Muziejaus rinkinių ir kitų tyrimų rezultatus;
10.4. bendradarbiauja su valstybinėmis, tarptautinėmis ir visuomeninėmis organizacijomis;
10.5. organizuoja neformalųjį vaikų ir suaugusiųjų švietimą, rengia ir vykdo edukacijos programas;
10.6. rengia, leidžia ir platina su Muziejaus veikla susijusius leidinius;
10.7. pristato Muziejaus rinkinius, veiklą ir virtualias parodas viešojoje erdvėje;
10.8. organizuoja konferencijas, seminarus, kitus renginius, susijusius su Muziejaus veiklos tikslais;
10.9. vykdo Kauno tvirtovės IX forto (Unikalus kodas kultūros vertybių registre 10452) priežiūrą;
10.10. atlieka savo rūšies Lietuvos muziejų ir juose esančių rinkinių metodinio apsaugos, apskaitos, eksponavimo ir tyrimo centro funkcijas;
10.11. rengia ir įgyvendina regioninius, nacionalinius, tarptautinius, Europos Sąjungos Struktūrinių fondų ir iš kitų programų finansuojamus projektus;
10.12. prisideda prie istorijos rūšies muziejų darbuotojų tobulinimosi programų rengimo ir vykdymo;
10.13. dalyvauja rengiant ir įgyvendinant Lietuvos muziejų fondų kompiuterizuotos apskaitos programas;
10.14. užtikrina Muziejaus rinkinių prieinamumą visuomenei, vykdo muziejinių vertybių skaitmeninimą, bendradarbiauja skaitmeninimo projektuose Lietuvoje ir užsienyje;
10.15. pagal juridinių ir fizinių asmenų prašymus, Muziejaus pasirašytas sutartis teikia muziejinių vertybių skaitmenintus vaizdus;
10.16. plėtoja lankytojų aptarnavimo paslaugas;
10.17. plėtoja kultūrinio turizmo veiklas;
10.18. dalyvauja Ministerijos atstovams kontroliuojant istorijos rūšies muziejų veiklą ir jų rinkinių apskaitą ir apsaugą;
10.19. atlieka kitas teisės aktuose numatytas funkcijas.